CYTOGENETIKA HEMATOLOGICKÝCH MALIGNÍT
Národný onkologický ústav
ODDELENIE GENETIKY
Klenová 1, 833 10 Bratislava 37 tel.: 02 59378 389
V súčasnosti ponúkame tieto vyšetrenia hematologických malignít
ODDELENIE GENETIKY
Klenová 1, 833 10 Bratislava 37 tel.: 02 59378 389
V súčasnosti ponúkame tieto vyšetrenia hematologických malignít
CYTOGENETICKÉ FISH MOLEKULOVO-GENETICKÉ
FISH analýza
CML
t(9;22) | +8 | i(17q)/p53
MDS, AML
del(5q) | del(7q)
AML M2
t(8;21)
AML M3
t(15;17) | aberácie 17q=rara
AML M4
inv(16)
AML,ALL
aberácie 11q=mll
ALL
t(9;22) | t(12;21) | p16(9p) | SIL/TAL | TLX3 | TCF3 | ETV6(TEL)
CLL
del(13q) | aberácie 14q=IgH | p53, ATM, +12
HCL
t(11;14) | del(6q)
LPO, myelom, lymfom
del(13q)=rb1 | aberácie 14q=IgH | del(6q) | ALK | 8q(C-myc)
TKD/chimérizmus
XY
PLOIDIA
centromérová 4,6,7,8,9,10,12,17
DELÉCIE, AMPLIFIKÁCIE, PRESTAVBY
celochromozómové 2,3,4,6,8,9,10,12,13,14,15,16,18,20,21,22,X,Y
telomérové 1q, 10p, 19p, 20q, 22q
Burkittov lymfóm
t(8;14)
NHL
t(14;18) | t(2;5) | Bd6
Neuroblastóm
N-myc | i(17q) | 1p36
Ewing sarkóm
EWSR1 prestavby
Nádor prsníka
Her2/neu
-------------------------------------------------------------------------------
t(9;22) | +8 | i(17q)/p53
MDS, AML
del(5q) | del(7q)
AML M2
t(8;21)
AML M3
t(15;17) | aberácie 17q=rara
AML M4
inv(16)
AML,ALL
aberácie 11q=mll
ALL
t(9;22) | t(12;21) | p16(9p) | SIL/TAL | TLX3 | TCF3 | ETV6(TEL)
CLL
del(13q) | aberácie 14q=IgH | p53, ATM, +12
HCL
t(11;14) | del(6q)
LPO, myelom, lymfom
del(13q)=rb1 | aberácie 14q=IgH | del(6q) | ALK | 8q(C-myc)
TKD/chimérizmus
XY
PLOIDIA
centromérová 4,6,7,8,9,10,12,17
DELÉCIE, AMPLIFIKÁCIE, PRESTAVBY
celochromozómové 2,3,4,6,8,9,10,12,13,14,15,16,18,20,21,22,X,Y
telomérové 1q, 10p, 19p, 20q, 22q
Burkittov lymfóm
t(8;14)
NHL
t(14;18) | t(2;5) | Bd6
Neuroblastóm
N-myc | i(17q) | 1p36
Ewing sarkóm
EWSR1 prestavby
Nádor prsníka
Her2/neu
-------------------------------------------------------------------------------
MOLEKULOVÁ analýza
CML
t(9;22) bcr/abl
ALL
t(9;22) bcr/abl
t(12;21) tel/aml1
t(12;21) tel/aml1
t(1;19) mll/af4
t(4;11) e2a/pbx
MLL multiplex
del 1p sil/tal
AML M2
t(8;21) eto/aml1
AML M3
t(15;17) pml/rara
t(11;17) plzf/rara
t(5;17) npm/rara
AML M4
inv(16) cbfb/myh
NHL
t(14;18) bcl2/IgH
HCL,CLL
t(11;14) bcl1/IgH
IgH(CDR3) CDR3 lokus
Burkittov lymfóm
t(8;14) C-myc/IgH
DSRCT
t(11;22) EWS/WT1
Ewing sarkóm
t(11;22) EWS/FL1
t(21;22) EWS/ERG
Rhabdomyosarkóm
t(1;13) PAX3/FKHR2
t(2;13) PAX7/FKHR2
TKD
Y sekvencie
Synoviálny sarkóm
(X;18) SSx/SS18
-----------------------------------------------------------------------------------
t(9;22) bcr/abl
ALL
t(9;22) bcr/abl
t(12;21) tel/aml1
t(12;21) tel/aml1
t(1;19) mll/af4
t(4;11) e2a/pbx
MLL multiplex
del 1p sil/tal
AML M2
t(8;21) eto/aml1
AML M3
t(15;17) pml/rara
t(11;17) plzf/rara
t(5;17) npm/rara
AML M4
inv(16) cbfb/myh
NHL
t(14;18) bcl2/IgH
HCL,CLL
t(11;14) bcl1/IgH
IgH(CDR3) CDR3 lokus
Burkittov lymfóm
t(8;14) C-myc/IgH
DSRCT
t(11;22) EWS/WT1
Ewing sarkóm
t(11;22) EWS/FL1
t(21;22) EWS/ERG
Rhabdomyosarkóm
t(1;13) PAX3/FKHR2
t(2;13) PAX7/FKHR2
TKD
Y sekvencie
Synoviálny sarkóm
(X;18) SSx/SS18
-----------------------------------------------------------------------------------
ODDELENIE GENETIKY NOÚ
Klenová 1
833 10 Bratislava 37
Primár oddelenia: MUDr.Denisa Ilen?íková, PhD. tel.: 02 59378 485
Vedúca laborantka: Mária Matú?ková tel.: 02 59378 384, 379
Lekár: MUDr.Anton Karabino?, PhD. tel.: 02 59378 581
Cytogenetika: Mgr.Martina Dubasová tel.: 02 59378 617
RNDr. Eva Hanu?ovská, CSc.
Laboratórium: tel.: 02 59378 389
FISH: Mgr.Alena ?ákovi?ová tel.: 02 59378 388
Mgr.Adriana Ármaiová
Molekulová diagnostika: RNDr.Imrich Hikkel tel.: 02 59378 146
Skúmavky s materiálom musia byť oznašené
Kostná dreň - odobraž do heparínom prepláchnutej striekažky a prenies? do skúmavky s rozmrazeným, transportným médiom IMDM fy GIBCO (z genetiky), premie?až, do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
Periferná krv - odobraž 5 ml do heparínom prepláchnutej striekažky a prenies? do suchej skúmavky, premie?až, do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
Tkanivo - 1 cm3 nádorového tkaniva do skúmavky s fyziologickým roztokom alebo kultivažným médiom RPMI fy GIBCO (z genetiky), do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
Odber materiálu na molekulové vyšetrenie
Kostná dreň a periferná krv - odobraž 5 ml neheparinizovaného materiálu do 0,5 ml 0,05 M roztoku K3EDTA, do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
Tkanivo - 1 cm3 nádorového tkaniva do skúmavky s 0,05 M roztokom K3EDTA, do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
ťažší materiál
Na FISH je možné poučiť aj
- odtlažkové preparáty z nefixovaného tkaniva a nátery. Na čisté, odmastené, suché podlo?né sklá (3-4) staží poriadne otlaži? vzorku materiálu a nechaž zaschnú? pri laboratórnej teplote. Takéto preparáty je možné zaslaž aj poštou.
- parafínové rezy (tumor-parafín blo?ek). Takéto preparáty je možné zaslaž aj poštou.
Klenová 1
833 10 Bratislava 37
Primár oddelenia: MUDr.Denisa Ilen?íková, PhD. tel.: 02 59378 485
Vedúca laborantka: Mária Matú?ková tel.: 02 59378 384, 379
Lekár: MUDr.Anton Karabino?, PhD. tel.: 02 59378 581
Cytogenetika: Mgr.Martina Dubasová tel.: 02 59378 617
RNDr. Eva Hanu?ovská, CSc.
Laboratórium: tel.: 02 59378 389
FISH: Mgr.Alena ?ákovi?ová tel.: 02 59378 388
Mgr.Adriana Ármaiová
Molekulová diagnostika: RNDr.Imrich Hikkel tel.: 02 59378 146
Skúmavky s materiálom musia byť oznašené
- meno pacienta
- rok narodenia pacienta
- druh biologického materiálu (KD, PK, tkanivo)
- odberové médium
- protizrážanlivý roztok (heparín, EDTA)
- meno pacienta
- rodné číslo
- kód poisťovne
- pe?iatka s kódom lekára ?pecialistu
- diagnózu slovom a číslom (pri zmene diagnózy je nutné ju urýchlene nahlási? telefonicky, predídeme tým drahým a zbyto?ným vyšetreniam a stratám materiálu)
- pohlavie darcu, ak je pacient po alogénnej TKD
- druh biologického materiálu (kostná dreň, periferná krv, periferné kmenové bunky, tkanivo)
- počet skúmaviek na jednotlivé vyšetrenia (cytogenetické a FISH, molekulové)
Kostná dreň - odobraž do heparínom prepláchnutej striekažky a prenies? do skúmavky s rozmrazeným, transportným médiom IMDM fy GIBCO (z genetiky), premie?až, do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
Periferná krv - odobraž 5 ml do heparínom prepláchnutej striekažky a prenies? do suchej skúmavky, premie?až, do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
Tkanivo - 1 cm3 nádorového tkaniva do skúmavky s fyziologickým roztokom alebo kultivažným médiom RPMI fy GIBCO (z genetiky), do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
Odber materiálu na molekulové vyšetrenie
Kostná dreň a periferná krv - odobraž 5 ml neheparinizovaného materiálu do 0,5 ml 0,05 M roztoku K3EDTA, do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
Tkanivo - 1 cm3 nádorového tkaniva do skúmavky s 0,05 M roztokom K3EDTA, do trasportu uchovávaž pri 2-8°C
ťažší materiál
Na FISH je možné poučiť aj
- odtlažkové preparáty z nefixovaného tkaniva a nátery. Na čisté, odmastené, suché podlo?né sklá (3-4) staží poriadne otlaži? vzorku materiálu a nechaž zaschnú? pri laboratórnej teplote. Takéto preparáty je možné zaslaž aj poštou.
- parafínové rezy (tumor-parafín blo?ek). Takéto preparáty je možné zaslaž aj poštou.